首先把NP2压缩包和BIOS包解压到同一个目录下。
启动NP2，等待自检完成，出现How many files时直接按回车。
出现如下界面：（图1）
进入Emulate菜单，选择Configure。（图2）
CPU速度和机型PC9801VX不用改，声音选项选44khz、100ms.
Screen 下的选项和一般其他模拟器没太大差别，都是些全屏、自动跳帧之类的选项，最后一项Screen Option里的CHIP选项卡中要选中EGC，其他的不用改。
Device下Keyboard中的Joykey是用键盘模拟手柄，一些情况有用；下面F12=是F12键对应的快捷键。（*小提示：这里有几个不能设置的快捷键，比如END=HELP，右ALT=KANA，还有很多键位的作用和PC键盘不同，要自己适应一下。）（图3）
Sound中的音源选项，建议不用修改，86音源能对应几乎所有的非Windows PC98游戏。Seek sound是模拟软驱读盘的声音，会使读软盘速度和实机相同，可选可不选。（图4）
Memory如果需要运行某些大程序，可以考虑选大一点，不过1.6MB对付大部分游戏足够了。
如果需要模拟MIDI输出，下面的MIDI Option是需要看一下的。（图5）
I/O端口和中断不用改，MIDI-OUT中选中现在使用的MIDI输出设备。
Other中有截图、手柄反向/连射、鼠标连射的选项，有时候会有用处。（图6）
然后还要进行BIOS设置，选Emulate下的RESET，按住HELP（END）键。（图7）
第一个里面的都不用改。第二个里面的メモリスイッチ改成保持する，GDCクロック是个重要的选项，如果运行游戏时出现这个相关的错误提示，就要更改此项。
第四个メモリスイッチ里面主要是改扩张ボード，把サウンドボード改成使用する，这样就可以避免一部分早期游戏出现无声的情况。还有个数值演算プロセッサ（数学协处理器）在某些时候是要打开的。
很多人说PC98的模拟器难用，主要在于PC98是电脑而不是游戏机，游戏媒体很复杂，不是那么容易进入游戏的，而且对于DOS游戏和早期游戏而言，说明书基本找不到，操作游戏系统也不是那么简单的事情。PC98游戏一般分为软盘版和光盘版，而到模拟器界又分作软盘镜像、硬盘镜像和ISO。NP2目前不支持对光驱的模拟，现在介绍的是前两类游戏如何模拟。
先以英雄传说4为例介绍软盘镜像媒体游戏的使用。
首先在菜单FDD1下选中OPEN。打开游戏的第一张盘（首页发出的软盘版ED4中第一张盘的文件名是Dragonslayer Eiyu Densetsu 4 (1996)(Falcom)(Disk 1 of 8)(Program Disk).fdi）（*提示：一般PC98游戏的Disk1、DiskA或者是System disk、Program disk都是可以引导系统,有些必须在FDD1放DISK1，FDD2放DISK2才能启动），RESET。（图8）
听到ED4熟悉的标题音乐了吧？但是菜单中只有一个选项可用。ユーサーディスクを作成する 现在需要制作一张用户盘（PC98游戏的用户盘可能有两种用途：存档、启动游戏，或者两者兼有）才能玩游戏。先制作一个空的磁盘镜像（Emulate下选中NewDisk，任意取一个能记住的文件名，注释可以不填，格式选2HD），在FDD2菜单下打开这个新建的.d88文件。选择ユーサーディスクを作成する ，按提示按空格键，等一段时间会出现完成提示，把用户盘换到A驱（其实就是在FDD1下再打开这个新建的.d88文件）按空格。菜单项就都可用了（图9）
由于是新用户盘，按新游戏或者继续游戏都是开始新游戏。一按回车游戏就提示……（图10）
要在软驱B（即FDD2）中插入Data disk 5……自己找那张盘的镜像把（不是整个游戏的DISK 5）……（有些游戏镜像名字不很清楚，可能需要逐张试验）之后碰到类似的提示就知道是要干什么了。
看完片头后`就可以开始游戏了，以后就用刚做好的用户盘启动游戏（PS：ED4软盘版经常需要换盘，一遇敌就要换盘，再进城镇或洞窟又要换盘……）（图11）
硬盘版游戏的使用相对简单些。在Harddisk下的SASI #1下打开一个HDI文件，把两个软驱都Eject，再RESET一般能够直接进入游戏。但是NP2的CPU不支持保护模式和虚拟8086模式，使用了EMM386、SMARTDRV之类程序的配置的HDI配置是不能用的。PC9801的硬盘主引导纪录内置了多重引导系统，SASI1、2都放了HDI的话，可以选择从哪个盘的哪个分区启动系统。
补充：关于NP2的软键盘和即时状态保存功能
在标题栏上点右键，选中Soft Keyboard打开软键盘。（图12）
这里可以使用9801中期型键盘上的所有键，某些时候很有用。
在np2.ini的[NekoProjectII]字段添加statsave=true，可以打开模拟器的即时状态保存功能。
不过目前尚未对.s0x文件压缩的能力，占用空间很多（在内存设置为1.6M时，一个就是2.6M）
而且似乎不太稳定`
PC9801上游戏每个都有自己的使用方法，很多是要靠自己摸索的`
[ 此贴被yksoft1在2005-08-18 13:02重新编辑 ]
